Liên Kết Photphodieste

     

các liên kết phosphodiester chúng là các liên kết cộng hóa trị xẩy ra giữa nhì nguyên tử oxy của tập thể nhóm photphat và nhóm hydroxyl của nhì phân tử khác. Trong loại liên kết này, đội phốt phát chuyển động như một "cầu nối" links ổn định giữa hai phân tử thông qua các nguyên tử oxy của nó.

Bạn đang xem: Liên kết photphodieste

Vai trò cơ bản của liên kết phosphodiester trong tự nhiên là sự thuphikhongdung.vnệc hình thành những chuỗi axit nucleic của tất cả DNA với RNA. Thuộc với những loại đường pentose (deoxyribose hoặc ribose, phụ thuộc vào từng trường hợp), các nhóm phosphate là 1 phần trong cấu trúc hỗ trợ của các phân tử sinh học đặc biệt quan trọng này.

*

Các chuỗi nucleotide của DNA hoặc RNA, y như protein, rất có thể đảm thừa nhận sự cân xứng ba chiều không giống nhau được định hình bởi những liên kết không cùng hóa trị, ví dụ như liên kết hydro giữa các cơ sở bửa sung.

Tuy nhiên, kết cấu chính được gửi ra do trình tự tuyến tính của những nucleotide liên kết cộng hóa trị bởi link phosphodiester.

Chỉ số

1 Làm thay nào một links phosphodiester được hình thành? 1.1 Enzyme liên quan2 Hàm và ví dụ3 tư liệu tham khảo

Làm vậy nào một links phosphodiester được hình thành?

Giống như links peptide trong protein và liên kết glycosid giữa các monosacarit, link phosphodiester là công dụng của các phản ứng mất nước trong số ấy một phân tử nước bị mất. Dưới đấy là phác thảo bình thường của giữa những phản ứng thoát nước này:

H-X1-OH + H-X2-OH → H-X1-X2-OH + H2Ôi

Các ion photphat khớp ứng với gốc phối hợp đã khử hoàn toàn của axit photphoric cùng được điện thoại tư vấn là phốt phát vô cơ, tên thuphikhongdung.vnết tắt của nó được cam kết hiệu là Pi. Khi hai đội phốt vạc được links với nhau, một links photphat khan được có mặt và một phân tử được gọi là pyrophosphate vô cơ hoặc PPi thu được.

Khi một ion photphat được gắn vào trong 1 nguyên tử carbon của một phân tử hữu cơ, liên kết hóa học tập được hotline là este phốt phát với loài thu được là 1 monophosphate hữu cơ. Nếu như phân tử hữu cơ liên kết với nhiều hơn nữa một đội phốt phát, thì những diphosphate hữu cơ hoặc triphosphate được hình thành.

Khi một phân tử phốt vạc vô cơ links với hai nhóm hữu cơ, liên kết phosphodiester hoặc "diester phosphate" được sử dụng. Điều đặc biệt quan trọng là ko nhầm lẫn những liên kết phosphodiester với những liên kết phosphoanhydro tích điện cao giữa những nhóm phân tử phosphate như ATP, ví dụ.

*

Liên kết photphodiester giữa những nucleotide liền kề bao gồm hai links phosphoester xảy ra giữa hydroxyl tại đoạn 5 "của nucleotide với hydroxyl ở phần 3" của nucleotide tiếp theo trên chuỗi DNA hoặc RNA.

Tùy nằm trong vào điều kiện của môi trường, các liên kết này có thể bị thủy phân bao gồm cả mặt enzyme và không enzyme.

Enzyme liên quan

Sự ra đời và phá vỡ các liên kết chất hóa học là rất quan trọng đặc biệt đối với tất cả các vượt trình quan trọng như bọn họ biết với trường hợp liên kết phosphodiester không phải là một trong những ngoại lệ.

trong số các enzyme đặc biệt nhất rất có thể hình thành các liên kết này là DNA hoặc RNA polymerase với ribozyme. Những enzyme phosphodiesterase hoàn toàn có thể thủy phân chúng.

Xem thêm: Giải Bài Tập Toán Lớp 5 Bài Tập Toán 5, Giải Vở Bài Tập Toán 5

Trong quy trình sao chép, một thừa trình quan trọng cho sự tăng sinh tế bào, trong những chu kỳ phản bội ứng, một dNTP (deoxynucleotide triphosphate) bổ sung cho cửa hàng mẫu được gửi vào DNA bởi phản ứng gửi nucleotide.

Các polymerase phụ trách hình thành một link mới thân 3"-OH của chuỗi mẫu mã và α-phosphate của dNTP, nhờ tích điện được giải hòa từ sự phá vỡ liên kết giữa những α cùng β phốt phạt của dNTP, được liên kết bằng links phosphoanhydro.

Kết quả là sự thuphikhongdung.vnệc mở rộng lớn chuỗi bằng một nucleotide cùng giải phóng một phân tử pyrophosphate (PPi) s. Tín đồ ta đã xác minh rằng phần đa phản ứng này xứng đáng với hai ion magiê hóa trị hai (Mg2+), gồm sự hiện tại diện có thể chấp nhận được ổn định tĩnh điện của nucleophile OH- để có được sự giao động với vị trí hoạt động vui chơi của enzyme.

các pKmột của một links phosphodiester gần bằng 0, vày vậy trong hỗn hợp nước, những liên kết này bị ion hóa trả toàn, tích năng lượng điện âm.

Điều này đem về cho những phân tử axit nucleic một năng lượng điện âm, được trung hòa - nhân chính nhờ những tương tác ion với các điện tích dương của dư lượng axit amin protein, để link tĩnh năng lượng điện với các ion sắt kẽm kim loại hoặc links với polyamines.

Trong hỗn hợp nước, liên kết phosphodiester trong số phân tử DNA bất biến hơn nhiều so với những phân tử RNA. Vào một dung dịch kiềm, các liên kết trong số phân tử RNA được phân tách bóc bằng sự di chuyển nội phân tử của nucleoside nghỉ ngơi đầu 5 "bởi một oxymate 2"..

Hàm cùng ví dụ

Như sẽ đề cập, vai trò liên quan nhất của các liên kết này là sự tham gia của chúng vào sự hình thành bộ xương của các phân tử axit nucleic, là những phân tử quan trọng nhất trong quả đât tế bào.

Hoạt động của những enzyme topoisomerase, tham gia tích cực vào vượt trình xào nấu DNA cùng tổng hòa hợp protein, dựa vào vào sự tương tác của các liên kết phosphodiester ở đầu 5 "của DNA với chuỗi dư lượng tyrosine sinh sống vị trí hoạt động của các chất này enzyme.

Các phân tử thâm nhập với tư biện pháp là sứ giả sản phẩm hai, ví dụ như cyclic adenosine monophosphate (cAMP) hoặc cyclic guanosine triphosphate (cGTP), có các liên kết phosphodiester bị thủy phân bởi những enzyme rõ ràng được gọi là phosphodiesterase. Di động.

Xem thêm: Bài Soạn Văn 10 Bài Cảnh Ngày Hè Ngắn Nhất, Bài Soạn Siêu Ngắn: Cảnh Ngày Hè

Glycerophospholipids, nhân tố cơ bạn dạng trong màng sinh học, gồm một phân tử glycerol được liên kết bởi những liên kết phosphodiester với các nhóm "đầu" cực tạo nên vùng ưa nước của phân tử.

Tài liệu tham khảo

Fothergill, M., Goodman, M.F., Petruska, J., & Warsrc, A. (1995). So sánh cấu trúc-năng lượng về vai trò của những ion kim loại trong quá trình thủy phân link photphodiester bằng DNA polymerase I. Tạp chí của cộng đồng Hóa học tập Hoa Kỳ, 117(47), 11619-11627.Lodish, H., Berk, A., Kaiser, C.A., Krieger, M., Bretscher, A., Ploegh, H., Martin, K. (2003). Sinh học tế bào phân tử (Tái bạn dạng lần sản phẩm công nghệ 5). Freeman, W. H. Và Công ty.Nakamura, T., Zhao, Y., Yamagata, Y., Hua, Y. J., & Yang, W. (2012). Coi DNA polymerase tạo links phosphodiester. Thiên nhiên, 487(7406), 196-201.Nelson, D. L., và Cox, M. M. (2009). Nguyên tắc sinh hóa của Lehninger. Phiên phiên bản Omega (Tái phiên bản lần vật dụng 5)Oivanen, M., Kuusela, S., & Lönnberg, H. (1998). Động học và cơ chế cho sự phân bóc tách và đồng phân hóa những liên kết phosphodiester của RNA bằng những axit với bazơ bronsted. Nhận xét hóa học, 98(3), 961-990.Pradeepkumar, P.I., Höbartner, C., Baum, D., & Silverman, S. (2008). Sự hiện ra xúc tác DNA của các liên kết Nucleopeptide. Phiên phiên bản quốc tế Angewandte Chemie, 47(9), 1753-1757.Soderberg, T. (2010). Hóa học hữu cơ với một nhấn mạnh vấn đề sinh tiếp thu kiến thức II (Tập II). Minnesota: Giếng hiện đại số của Đại học tập Minnesota. Lấy từ www.digitalcommons.morris.umn.edu